Modyfikatory genetyczne choroby płuc w mukowiscydozie ad

Klasyfikacja czynności płuc jako ciężka lub łagodna (tj. Najniższy lub najwyższy kwartyl funkcji płuc dla wieku) została potwierdzona przez oszacowanie końcowej objętości wymuszonej wydechowej w ciągu jednej sekundy (FEV1) dla każdego pacjenta na podstawie wielu pomiarów spirometrycznych podczas pięciu lata przed rejestracją (patrz Dodatek dodatkowy, dostępny wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie www.nejm.org). Genotypy wariantów modyfikatorów porównano w grupach pacjentów z ciężkim lub łagodnym fenotypem, w sposób podobny do projektu kontrolnego przypadku. Replikowaliśmy nasze wyniki w innej populacji pacjentów z mukowiscydozą. Metody
Pacjenci
Do wstępnego badania próbka składała się z pacjentów z mukowiscydozą, zapisanych z 44 miejsc, którzy byli homozygotyczni pod względem mutacji .F508. 840 pacjentów, którzy zostali wstępnie zapisani, wybrano, ponieważ ich pomiary FEV1 były w najniższym kwartylu lub najwyższym kwartylu dla wieku wśród homozygot F508. Czynność płuc u 275 tych pacjentów została sklasyfikowana jako poważnie upośledzona (najniższy kwartyl), a u 565 pacjentów jako nieznacznie upośledzona (najwyższy kwartyl). W sumie 32 pacjentów zostało wykluczonych z powodu niewystarczających spirogramów (2 pacjentów), nie byli homozygotyczni pod względem mutacji .F508 (8) lub nie mieli więcej niż 90% prawdopodobieństwa, że ich czynność jest zgodna z czynnościami innych osób w ciężkim przebiegu choroby. lub łagodna kategoria (22) (patrz Sprawdzanie oryginalności w dodatkowym dodatku). W ostatecznym zestawie danych było 808 pacjentów. Żaden pacjent nie został wykluczony z powodu rasy lub pochodzenia etnicznego; 96,7% pacjentów zostało zidentyfikowanych jako białe.
W badaniu replikacji przetestowaliśmy 498 pacjentów, których hodowle plwociny były negatywne dla Burkholderia cepacia i którzy mieli genotypy CFTR związane z trzustkową niewydolnością zewnątrzwydzielniczą; 70,5 procent było homozygotami F508. Podobnie jak w początkowym badaniu, żaden pacjent nie został wykluczony z powodu rasy lub pochodzenia etnicznego. Większość pacjentów uczestniczących w badaniu replikacji pochodzi z badań przeprowadzonych na Uniwersytecie Północnej Karoliny w Chapel Hill, Case Western Reserve University w Cleveland lub w szpitalu dla chorych dzieci w Toronto (dodatek uzupełniający). Badanie zostało zaaprobowane przez biomedyczną instytucję ds. Przeglądu instytucjonalnego Uniwersytetu w Północnej Karolinie i instytucjonalną komisję odwoławczą każdej z uczestniczących instytucji. Pacjenci i rodzice nieletnich wyrazili pisemną świadomą zgodę.
Zbieranie danych
Do wstępnego badania każdy pacjent otrzymał unikalny kod, który został użyty do umożliwienia przetwarzania danych przy zachowaniu anonimowości. Kluczowe dane uzyskano z dokumentów źródłowych, w tym z raportów funkcji płucnych z poprzednich pięciu lat, które dostarczyły pomiarów wysokości i masy ciała do obliczenia wskaźnika masy ciała jako wskaźnika odżywiania i badania mikrobiologicznego plwociny w ciągu poprzednich trzech lat. Inne dane uzyskano na formularzach opisujących przypadki. Do badania replikacji wykorzystaliśmy dane FEV1, które były dostępne na stronach (dodatek dodatkowy).
Genotypowanie
Do wstępnego badania przeprowadzono testy genetyczne poprzez sekwencjonowanie alleli .1AP-Z i MBL2 B, C i D zerowych ; za pomocą technologii polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP) (BeadArray, Illumina) dla alleli .1AP-S i G1237A, GSTP1, IL10, promotorów MBL2 wariantów X i Y, NOS3 i TGF.1; lub opublikowanymi metodami dla ACE, ADR.2, GSTM1 i TNF. (dodatek dodatkowy)
[więcej w: kanabidiol, kardiolog dziecięcy warszawa nfz, usg stopy warszawa ]
[więcej w: dorota gwiazdowska, cartexim, zdz słupsk ]